Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCC13Q9NSE7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms