Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LHX9Q9NQ69 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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LHX9Q9NQ69 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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LHX9Q9NQ69 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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LHX9Q9NQ69 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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LHX9Q9NQ69 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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LHX9Q9NQ69 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LHX9Q9NQ69 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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