Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KIAA1549Q9HCM3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KIAA1549Q9HCM3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms