Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CENPJQ9HC77 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms