Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LIN28AQ9H9Z2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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