Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NXF3Q9H4D5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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