Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6BQ9H3T3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6BQ9H3T3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms