Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNMDQ9H2S6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNMDQ9H2S6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms