Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SIL1Q9H173 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIL1Q9H173 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms