Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP4AQ9BY43 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms