Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RSPO3Q9BXY4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms