Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDC1Q9BTX1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NDC1Q9BTX1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms