Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EBF4Q9BQW3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms