Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms