Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CITED2Q99967 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CITED2Q99967 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms