Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5Q99717 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD5Q99717 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD5Q99717 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD5Q99717 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD5Q99717 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD5Q99717 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD5Q99717 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD5Q99717 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD5Q99717 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD5Q99717 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD5Q99717 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD5Q99717 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD5Q99717 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms