Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POP1Q99575 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POP1Q99575 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POP1Q99575 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POP1Q99575 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POP1Q99575 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POP1Q99575 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POP1Q99575 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POP1Q99575 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POP1Q99575 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POP1Q99575 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POP1Q99575 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms