Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUDCD1Q96RS6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NUDCD1Q96RS6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms