Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEURL4Q96JN8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEURL4Q96JN8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms