Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBM17Q96I25 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM17Q96I25 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBM17Q96I25 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM17Q96I25 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM17Q96I25 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM17Q96I25 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM17Q96I25 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM17Q96I25 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM17Q96I25 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM17Q96I25 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM17Q96I25 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM17Q96I25 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBM17Q96I25 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms