Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM3Q96HU1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM3Q96HU1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM3Q96HU1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM3Q96HU1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM3Q96HU1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM3Q96HU1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGSM3Q96HU1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGSM3Q96HU1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGSM3Q96HU1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM3Q96HU1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms