Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms