Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
MTERF3Q96E29 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms