Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HDAC11Q96DB2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms