Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-CQ95604 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms