Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP6NLQ92738 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6NLQ92738 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms