Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HDAC7Q8WUI4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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