Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA6DQ8NFY4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SEMA6DQ8NFY4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms