Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNNM3Q8NE01 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNNM3Q8NE01 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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