Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH13Q8NBN7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH13Q8NBN7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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