Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP38Q8NB14 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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