Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF1Q8N6C5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms