Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPC2Q8N158 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPC2Q8N158 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms