Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFNL1Q8IU54 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFNL1Q8IU54 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms