Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP4Q86YS3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP4Q86YS3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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