Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATG4DQ86TL0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATG4DQ86TL0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms