Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2Q1Q7Z7E8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2Q1Q7Z7E8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms