Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE3BQ7Z3V4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3BQ7Z3V4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms