Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST3Q7LGC8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST3Q7LGC8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST3Q7LGC8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST3Q7LGC8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHST3Q7LGC8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHST3Q7LGC8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHST3Q7LGC8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHST3Q7LGC8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHST3Q7LGC8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHST3Q7LGC8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHST3Q7LGC8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHST3Q7LGC8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST3Q7LGC8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms