Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP50Q70EL3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP50Q70EL3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms