Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP53Q70EK8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP53Q70EK8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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