Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf139Q6ZV77 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms