Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FAM43BQ6ZT52 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM43BQ6ZT52 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms