Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC141Q6ZP82 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC141Q6ZP82 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms