Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms