Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX8Q68G74 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LHX8Q68G74 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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