Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CHIC1Q5VXU3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC1Q5VXU3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms