Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOCADQ5VW36 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOCADQ5VW36 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms