Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRCH2Q5VUJ6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRCH2Q5VUJ6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms