Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RPRD2Q5VT52 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPRD2Q5VT52 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms